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<!DOCTYPE html>

<title>CRISPR/Cpf1-Methode</title>

</head>

<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">CRISPR/Cpf1-Methode</span></h1>

</header>

</div>

<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="de" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="de" dir="ltr"><p>Das <b>CRISPR/Cpf1-Methode</b> (<span style="font-style:normal;font-weight:normal"><a href="../Englische_Sprache" title="Englische Sprache">englisch</a></span> <span lang="en-Latn" style="font-style:italic"><i>Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats from Prevotella and Francisella</i></span>) ist eine biochemische Methode zur Erzeugung von <a href="../Gentechnisch_ver%C3%A4nderter_Organismus" title="Gentechnisch veränderter Organismus">gentechnisch veränderten Organismen</a>.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Eigenschaften">Eigenschaften</h2></div>

<p>Das CRISPR/Cpf1-System entstammt – wie auch das <a href="../CRISPR/Cas-Methode" title="CRISPR/Cas-Methode">CRISPR/Cas9-System</a> und das <a href="../CRISPR/Cas12b-System" class="mw-redirect" title="CRISPR/Cas12b-System">CRISPR/Cas12b-System</a> – einem adaptiven antiviralen Abwehrmechanismus, dem <a href="../CRISPR" title="CRISPR">CRISPR</a>, jedoch aus den Gattungen <i><a href="../Prevotella" title="Prevotella">Prevotella</a></i> und <i>Francisella</i>.<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> Wie bei diesem wurde und werden auf der Basis des Systems Methoden zur Nutzung des Systems als Werkzeug für die biotechnologische Forschung für verschiedene Organismen entwickelt.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Vergleich_mit_Cas9">Vergleich mit Cas9</h2></div>

<p>Im Vergleich zum CRISPR/Cas-System ist die beim CRISPR/Cpf1-System verwendete <a href="../Endonuklease" title="Endonuklease">Endonuklease</a> <a href="../Cpf1" title="Cpf1">Cpf1</a> (auch Cas12a genannt<sup id="cite_ref-DOI10.1126/science.aav7271_2-0" class="reference"><a href="#cite_note-DOI10.1126/science.aav7271-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>) ein kleineres <a href="../Enzym" title="Enzym">Enzym</a>, das nur eine RNA als Vorlage benötigt (keine <i>tracrRNA</i>), um doppelsträngige <a href="../DNA" class="mw-redirect" title="DNA">DNA</a> an einer gezielten Stelle zu schneiden. Weiterhin besitzt Cpf1 andere Erkennungs- und Schnittstellen und erzeugt einen Basenüberhang an einem der beiden DNA-Stränge (<i><a href="../Sticky_end" class="mw-redirect" title="Sticky end">sticky end</a></i>), der möglicherweise die homologe Rekombination erleichtert.<sup id="cite_ref-Ledford_3-0" class="reference"><a href="#cite_note-Ledford-3"><span class="cite-bracket">[</span>3<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> Wie für verschiedene Anwendungen des CRISPR/Cas-Systems, wurden auch für die Cpf1-basierten Genommanipulationen <a href="../Patent" title="Patent">Patente</a> angemeldet.<sup id="cite_ref-4" class="reference"><a href="#cite_note-4"><span class="cite-bracket">[</span>4<span class="cite-bracket">]</span></a></sup><sup id="cite_ref-transkri-201701_5-0" class="reference"><a href="#cite_note-transkri-201701-5"><span class="cite-bracket">[</span>5<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p><p><b>Unterschiede zwischen Cas9, Cpf1 und Cas12b</b>

</p>

<th>Eigenschaft</th>

</th></tr>

<tr>

<td><b>Struktur</b></td>

<td>2 RNA notwendig</td>

<td>1 RNA notwendig (keine <i>tracrRNA</i>)</td>

<td>2 RNA notwendig

</td></tr>

<tr>

<td><b>Überhang</b></td>

<td>keinen (blunt end)</td>

<td>sticky end</td>

<td>sticky end

</td></tr>

<tr>

<td><b>Schnittstelle</b></td>

<td>proximal zur Erkennungssequenz</td>

<td>distal zur Erkennungssequenz</td>

<td>distal zur Erkennungssequenz

</td></tr>

<tr>

<td><b>Zielsequenz</b></td>

<td>G-reiches <a href="../Protospacer_Adjacent_Motif" title="Protospacer Adjacent Motif">PAM</a></td>

<td>T-reiches PAM</td>

<td>T-reiches PAM

</td></tr>

<tr>

<td><b>Zelltyp</b></td>

<td><a href="../Zellteilung" title="Zellteilung">teilende Zellen</a></td>

<td><a href="../Ruhende_Zelle" title="Ruhende Zelle">ruhende Zellen</a></td>

<td>unbekannt

</td></tr></tbody></table>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>

<ul><li>Heidi Ledford: <i><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.spektrum.de/news/gentechnik-crispr-erleichtert-die-manipulation/1351915">Werkzeug der Genmanipulation - Gentechnik: CRISPR verändert alles</a></i>. In: <i><a href="../Spektrum_der_Wissenschaft" title="Spektrum der Wissenschaft">Spektrum der Wissenschaft</a>.</i> vom 24. Juni 2015.</li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text">R. Sorek, V. Kunin, P. Hugenholtz: <i>CRISPR–a widespread system that provides acquired resistance against phages in bacteria and archaea.</i> In: <i>Nature reviews. Microbiology.</i> Band 6, Nummer 3, März 2008, S. 181–186, <span class="-print"><a href="../Internationale_Standardnummer_f%C3%BCr_fortlaufende_Sammelwerke" title="Internationale Standardnummer für fortlaufende Sammelwerke">ISSN</a> <span style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://zdb-katalog.de/list.xhtml?t=iss%3D%221740-1534%22&key=cql">1740-1534</a></span></span>, <a href="../Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1038/nrmicro1793">10.1038/nrmicro1793</a></span>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18157154?dopt=Abstract">PMID 18157154</a>.</span>

</li>

<li id="cite_note-DOI10.1126/science.aav7271-2"><span class="mw-cite-backlink">↑ <sup><a href="#cite_ref-DOI10.1126/science.aav7271_2-0">a</a></sup> <sup><a href="#cite_ref-DOI10.1126/science.aav7271_2-1">b</a></sup></span> <span class="reference-text">Winston X. Yan, Pratyusha Hunnewell, Lauren E. Alfonse, Jason M. Carte, Elise Keston-Smith, Shanmugapriya Sothiselvam, Anthony J. Garrity, Shaorong Chong, Kira S. Makarova, Eugene V. Koonin, David R. Cheng, David A. Scott: <i>Functionally diverse type V CRISPR-Cas systems.</i> In: <i>Science.</i> 363, 2019, S. 88, <a href="../Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1126/science.aav7271">10.1126/science.aav7271</a></span>.</span>

</li>

<li id="cite_note-Ledford-3"><span class="mw-cite-backlink">↑ <sup><a href="#cite_ref-Ledford_3-0">a</a></sup> <sup><a href="#cite_ref-Ledford_3-1">b</a></sup> <sup><a href="#cite_ref-Ledford_3-2">c</a></sup></span> <span class="reference-text">Heidi Ledford: <i>Alternative CRISPR system could improve genome editing.</i> In: <i>Nature.</i> 526, 2015, S. 17, <a href="../Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1038/nature.2015.18432">10.1038/nature.2015.18432</a></span>.</span>

</li>

<li id="cite_note-4"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-4">↑</a></span> <span class="reference-text"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.economist.com/news/science-and-technology/21668031-scientists-have-found-yet-another-way-edit-genomes-suggesting-such-technology-will"><i>Even CRISPR: A new way to edit DNA may speed the advance of genetic engineering</i>.</a> In: <a href="../Economist" class="mw-redirect" title="Economist">Economist</a>, 3. Oktober 2015.</span>

</li>

<li id="cite_note-transkri-201701-5"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-transkri-201701_5-0">↑</a></span> <span class="reference-text"><span class="cite"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20170312045814/http://www.transkript.de/nachrichten/wirtschaft/2017-01/epo-erteilt-crispr-patent-an-broad.html"><i>EPO erteilt CRISPR-Patent an Broad.</i></a> In: <i><a href="../Transkript_(Zeitschrift)" title="Transkript (Zeitschrift)">transkript.de</a>.</i> 28. Februar 2017, archiviert vom <style data-mw-deduplicate="TemplateStyles:r250917974">

/* start https://de.wikipedia.org/ */

.mw-parser-output .dewiki-iconexternal>a{background-position:center right!important;background-repeat:no-repeat!important}body.skin-minerva .mw-parser-output .dewiki-iconexternal>a{background-image:url("../_mw_/OOjs_UI_icon_external-link-ltr-progressive.svg")!important;background-size:10px!important;padding-right:13px!important}body.skin-timeless .mw-parser-output .dewiki-iconexternal>a,body.skin-monobook .mw-parser-output .dewiki-iconexternal>a{background-image:url("../_mw_/MediaWiki_external_link_icon.svg")!important;padding-right:13px!important}body.skin-vector .mw-parser-output .dewiki-iconexternal>a{background-image:url("../_mw_/Link.ernal-small-ltr-progressive.svg")!important;background-size:0.857em!important;padding-right:1em!important}

/* end https://de.wikipedia.org/ */

</style><span class="dewiki-iconexternal"><a class="external text" href="https://redirecter.toolforge.org/?url=http%3A%2F%2Fwww.transkript.de%2Fnachrichten%2Fwirtschaft%2F2017-01%2Fepo-erteilt-crispr-patent-an-broad.html">Original</a></span> (nicht mehr online verfügbar) am <span style="white-space:nowrap;">12. März 2017</span><span>;</span><span class="Abrufdatum"> abgerufen am 9. März 2017</span>.</span><span style="display: none;" class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Adc&rfr_id=info%3Asid%2Fde.wikipedia.org%3ACRISPR%2FCpf1-Methode&rft.title=EPO+erteilt+CRISPR-Patent+an+Broad&rft.description=EPO+erteilt+CRISPR-Patent+an+Broad&rft.identifier=https%3A%2F%2Fweb.archive.org%2Fweb%2F20170312045814%2Fhttp%3A%2F%2Fwww.transkript.de%2Fnachrichten%2Fwirtschaft%2F2017-01%2Fepo-erteilt-crispr-patent-an-broad.html&rft.date=2017-02-28&rft.source=http://www.transkript.de/nachrichten/wirtschaft/2017-01/epo-erteilt-crispr-patent-an-broad.html"> </span></span>

</li>

<li id="cite_note-uniprot-072-6"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-uniprot-072_6-0">↑</a></span> <span class="reference-text"><a href="../UniProt" title="UniProt">UniProt</a> <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.uniprot.org/uniprotkb/T0D7A2">T0D7A2</a>: cas12b – CRISPR-associated endonuclease Cas12b – Alicyclobacillus acidoterrestris (strain ATCC 49025 / DSM 3922 / CIP 106132 / NCIMB 13137 / GD3B) – cas12b gene (uniprot.org) (englisch) vom 16.10.2013, abgegriffen 24.01.2019</span>

</li>

</ol></div><div><div class="zim-footer">

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